我国已完成测序获得较完整的木薯基因组草图
文章来源:中国热带农业科学院 更新时间:2010-1-20 10:22:21
1月16日,在海南博鳌举行的首届中国农业科技创新论坛上,中国热带农业科学院热带生物技术研究所所长彭明宣布,以中国热带农业科学院王文泉研究员为项目负责人的研究团队仅用1年的时间,已经完成3个木薯品种的基因组深度测序,同时采用几种超高通量测序技术,综合组装获得较完整的基因组草图。
据彭明介绍,木薯是三大薯类作物之一,全球第六大粮食作物,被誉为“淀粉之王”,是世界6亿人口赖以生存的食粮。在我国,木薯作为新型能源、工业原料和潜在的粮食作物,具有良好的发展潜力,是热带地区最重要的经济作物之一,现有面积50余万公顷,产量1000万吨,年总产值140亿元,潜在面积150万公顷,预计年产值在500亿元。
“十一五”初期(2006年),中国热带农业科学院在全球组建了木薯基因组学与生物技术研究团队,由院所两级资助,实施了木薯全基因测序。只用了一年的时间,就完成了木薯推广品种Ku50(高淀粉)和W14(野生祖先种)和CAS36(糖木薯)3个木薯品种的基因组深度测试,同时采用Solexa、454和BAC混拼策略完成基因组数据组装。
“我国在木薯基础生物学与基因组研究领域,已处于国际领先地位。”彭明说,截至目前,美国只完成了1个木薯品种的基因组草图,而我国完成了3个。这些基础数据的获取,不仅能够阐明木薯基因组结构的基本特征,如基因在染色体上的线性分布、基因数量及其多样化演化,为全球采用新技术开展木薯基础与应用研究提供了必不可少的工具;而且对于进一步破解木薯高效转化太阳能累积淀粉及抗旱耐贫瘠的分子调节机制奠定了基石。木薯全基因组测序计划的完成将对全球粮食安全和生物能源发展具有重要的科学意义。
我国在木薯研究领域已取得突出成绩。据中国热带农业科学院透露,在木薯产业研究方面,已经建立中国的木薯种质资源圃(450份,覆盖全球核心种质的85%);建立完整的种质评价、新品种选育、示范、推广体系,培育了华南系列品种15个,累计推广面积1100万公顷,新增产值约110亿元;实现了产业规模化发展,从原来分散的小规模的淀粉生产企业,发展到年产淀粉200万吨,燃料乙醇100万吨,年进口木薯300万吨干片的产业规模,带动农村就业100万人以上;“木薯品种选育及产业化关键技术集成与应用”获得2009年国家科技进步二等奖;木薯品种改良的基础研究还获得国家重大基础研究(973)项目资助,建立了我国木薯转基因育种技术平台等。
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